Diversos projetos já foram executados pela equipe junto à população indígena de MS. Dentre estes, podemos destacar:

• De 2001 a 2003 – Recuperação Ambiental da Microbacia Jakairá, desenvolvido na Terra Indígena de Caarapó, localizada no município de Caarapó, MS, promoveu a recuperação e construção de diversas represas de contenção da erosão, lazer e de criação de peixes para o consumo, construção e manutenção de um viveiro de mudas de espécies nativas e frutíferas exóticas, que serve de laboratório onde os alunos das escolas indígenas desenvolvem atividades relacionadas à educação ambiental.
• De 2001 a 2004 – Unidades de Pesquisa e Produção de Alimentos e Artesanato, projeto de viabilização de espaços de aprendizagem complementares a escola indígena na aldeia de Te’ýikue, Caarapó/MS, que foi premiado pelo Itaú/Unicef em 2003.
• De 2002 a 2003 – Criança Kaiowá e Guarani no Mato Grosso do Sul, financiado pela UNICEF, através do Fundo das Nações Unidas para a Infância.
• De 2009 a 2010, com apoio financeiro do Fundo de População das nações unidas/UNFPA, executou a Edição de um vídeo da viagem de intercâmbio dos Guarani pelas fronteiras entre o Brasil, Paraguai e Argentina.
• Em 2010, a DKA Áustria financiou o Projeto: Documentação da territorialidade Guarani e meio ambiente do MS, com o objetivo de produzir uma documentação que sirvam de subsídios aos procedimentos do Governo Federal de reconhecimento da territorialidade Guarani através de relatórios e material áudio visual.
• No ano de 2010, desenvolveu o projeto Apoio ao fortalecimento das Políticas Públicas entre os Índios Guarani na Região Transfronteiriça: Brasil, Paraguai e Argentina, desenvolvido em parceria com o Ministério Público Federal – 6º Câmara, Brasília, DF, e o NEPO/UNICAMP, com recursos da Embaixada da Espanha (AECID).
• 2017 a 2018 e 2021 a 2022, financiado pelo Fundo de Defesa e Reparação de Interesses Difusos e Lesados – Funles, do governo do Estado de Mato Grosso do Sul, o CAPI executou o projeto Ja´e , que surgiu a partir de uma roda de conversa entre os professores da aldeia Tey´kue, no município de Caarapó em Mato Grosso do Sul, e a equipe do CAPI. A ação realizou o levantamento, coleta e disponibilização do patrimônio cultural dos Kaiowá e Guarani, organizado em três grandes temas: Cultura Material, Cultura Imaterial e Recursos Naturais.

Em iniciativas mais abrangentes e que atendem demandas mais amplas dos povos indígenas, destacamos: o Projeto Rede de Saberes, voltado ao apoio aos acadêmicos índios em suas trajetórias nas Instituições de Ensino Superior, desenvolvido em parceria com as três Universidades Públicas de MS (UFGD, UFMS e UEMS) e com recursos da Fundação FORD; E, ainda, os Programas de formação de professores guarani e kaiowá, em nível médio e superior, organizados pela Secretaria de Educação do Estado de MS e Universidade Federal da Grande Dourados em parceria com Universidade Católica Dom Bosco.

Outra atuação importante foi a implementação do Centro de Documentação Antônio Brand que se constituiu em um espaço de pesquisa, registro e catalogação de acervo nas mídias áudio visual e impressa, além de produção bibliográfica sobre a história e os desafios contemporâneos vivenciados pelos povos indígenas no Estado de Mato Grosso do Sul. Foi um espaço acessível a inúmeros acadêmicos estagiários indígenas e não-indígenas. Os trabalhos do Centro de Documentação tiveram início em 2001. O CEDOC, conta com um acervo considerável de mais de 95 rolos de microfilmes, CD´s e arquivos digitais, além de inúmeras entrevistas com representantes indígenas sobre sua história, devidamente gravadas, transcritas e arquivadas.